Contenidos Teóricos
Tema 1.- Biomedicina: problemática y conceptos
Tema 2.- Búsqueda de patrones en el DNA
Tema 3.- Búsqueda de motivos en el DNA
Tema 4.- Ensamblaje de secuencias
Tema 5.- Transformada de Burrows Wheeler
Tema 6.- Análisis transcriptómico
Los contenidos prácticos se encuentran incrustados entre los contenidos prácticos, en forma de ejercicios que se desarrollan o explican durante la sesión teórica-práctica.
Tema 1- Manipulación y análisis estadístico básico de grandes cadenas de texto
Tema 2- Manipulación y análisis de múltiples cadenas de texto: comparación, combinación y estadística.
Tema 3 - Análisis de cadenas de texto con variabilidad en cada posición (mutaciones)
Tema 4 - Grafos de DeBruijn, ciclos Eulerianos y ensamblaje de contigs
Tema 5 - Arrays de sufijos, BWT, búsquedas avanzadas en cadenas genómicas.
Tema 6 - Clustering de k-medias y jerárquico. Anotaciones: parseo y enriquecimiento.